Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
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