Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3C2AO00443 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms