Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms