Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms