Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms