Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms