Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms