Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms