Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRCP1A6NGW2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms