Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms