Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms