Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms