Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLIC4Q9Y696 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLIC4Q9Y696 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIC4Q9Y696 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms