Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TNPO3Q9Y5L0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNPO3Q9Y5L0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms