Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF12Q9Y4X4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms