Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMED5Q9Y3A6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED5Q9Y3A6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms