Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNM6

PSMD13, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD13Q9UNM6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD13Q9UNM6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD13Q9UNM6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD13Q9UNM6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD13Q9UNM6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD13Q9UNM6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD13Q9UNM6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD13Q9UNM6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD13Q9UNM6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD13Q9UNM6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.1 ms