Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN88

GABRQ, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRQQ9UN88 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABRQQ9UN88 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABRQQ9UN88 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABRQQ9UN88 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABRQQ9UN88 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABRQQ9UN88 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABRQQ9UN88 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABRQQ9UN88 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABRQQ9UN88 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABRQQ9UN88 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GABRQQ9UN88 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GABRQQ9UN88 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GABRQQ9UN88 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GABRQQ9UN88 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms