Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP8AP2Q9UKL3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms