Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIC8

LCMT1, Leucine carboxyl methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT1Q9UIC8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCMT1Q9UIC8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCMT1Q9UIC8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCMT1Q9UIC8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms