Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL3Q9UH77 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL3Q9UH77 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms