Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TUBGCP4Q9UGJ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBGCP4Q9UGJ1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms