Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTTNBP2NLQ9P2B4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTTNBP2NLQ9P2B4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms