Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCKIPSDQ9NZQ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms