Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTEL1Q9NZ71 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTEL1Q9NZ71 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTEL1Q9NZ71 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms