Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GGA3Q9NZ52 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GGA3Q9NZ52 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GGA3Q9NZ52 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGA3Q9NZ52 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGA3Q9NZ52 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGA3Q9NZ52 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGA3Q9NZ52 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGA3Q9NZ52 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGA3Q9NZ52 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGA3Q9NZ52 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGA3Q9NZ52 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms