Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ43

USE1, Vesicle transport protein USE1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1Q9NZ43 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USE1Q9NZ43 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USE1Q9NZ43 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms