Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX18Q9NVP1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms