Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBRD1Q9NUN5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBRD1Q9NUN5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMBRD1Q9NUN5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms