Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM7SF3Q9NS93 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM7SF3Q9NS93 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms