Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB6BQ9NRW1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6BQ9NRW1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms