Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG4Q9H9E3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COG4Q9H9E3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms