Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXO5Q9H790 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.5 ms