Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A9

PCNX3, Pecanex-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX3Q9H6A9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNX3Q9H6A9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNX3Q9H6A9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNX3Q9H6A9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms