Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL4Q9C0H6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms