Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMES1Q9C002 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMES1Q9C002 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms