Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM2Q9BVW6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms