Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCMBPQ9BTE3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCMBPQ9BTE3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms