Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP9

Putative uncharacterized protein MGC13053, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9BRP9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9BRP9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9BRP9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9BRP9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9BRP9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9BRP9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9BRP9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9BRP9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9BRP9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9BRP9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9BRP9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9BRP9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9BRP9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9BRP9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9BRP9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9BRP9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9BRP9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9BRP9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9BRP9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9BRP9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9BRP9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9BRP9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9BRP9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9BRP9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9BRP9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9BRP9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9BRP9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9BRP9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9BRP9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9BRP9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9BRP9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9BRP9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9BRP9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9BRP9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9BRP9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9BRP9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9BRP9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9BRP9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9BRP9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9BRP9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9BRP9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9BRP9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9BRP9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9BRP9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9BRP9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9BRP9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9BRP9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9BRP9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9BRP9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9BRP9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9BRP9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9BRP9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9BRP9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9BRP9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9BRP9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9BRP9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9BRP9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9BRP9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9BRP9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9BRP9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9BRP9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9BRP9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9BRP9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9BRP9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9BRP9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9BRP9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9BRP9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9BRP9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9BRP9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9BRP9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9BRP9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9BRP9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9BRP9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9BRP9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9BRP9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9BRP9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9BRP9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9BRP9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9BRP9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9BRP9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9BRP9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9BRP9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9BRP9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9BRP9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms