Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRSF8Q9BRL6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF8Q9BRL6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms