Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZSWIM1Q9BR11 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZSWIM1Q9BR11 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms