Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN18Q99952 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN18Q99952 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN18Q99952 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN18Q99952 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms