Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.6 ms