Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC114Q96M63 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC114Q96M63 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC114Q96M63 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms