Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PHACTR3Q96KR7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PHACTR3Q96KR7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PHACTR3Q96KR7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PHACTR3Q96KR7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PHACTR3Q96KR7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PHACTR3Q96KR7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PHACTR3Q96KR7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PHACTR3Q96KR7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PHACTR3Q96KR7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PHACTR3Q96KR7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PHACTR3Q96KR7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PHACTR3Q96KR7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PHACTR3Q96KR7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
PHACTR3Q96KR7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PHACTR3Q96KR7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
PHACTR3Q96KR7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PHACTR3Q96KR7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PHACTR3Q96KR7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PHACTR3Q96KR7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PHACTR3Q96KR7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PHACTR3Q96KR7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PHACTR3Q96KR7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PHACTR3Q96KR7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PHACTR3Q96KR7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PHACTR3Q96KR7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PHACTR3Q96KR7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PHACTR3Q96KR7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms