Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A3Q96HJ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms