Protein–RNA interactions for Protein: Q96A25

TMEM106A, Transmembrane protein 106A, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106AQ96A25 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM106AQ96A25 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106AQ96A25 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106AQ96A25 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106AQ96A25 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106AQ96A25 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106AQ96A25 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106AQ96A25 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106AQ96A25 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106AQ96A25 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106AQ96A25 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106AQ96A25 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106AQ96A25 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106AQ96A25 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms