Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN3Q969G5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN3Q969G5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms