Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX19Q92543 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX19Q92543 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms