Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HAVCR2Q8TDQ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms