Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AGR3Q8TD06 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGR3Q8TD06 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms